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  Affymetrix芯片     ★★★
Affymetrix芯片
[ 作者:中国生物医药网    转贴自:中国生物医药网    点击数:3249    更新时间:5/21/2006    文章录入:admin

我们将利用Affymetrix公司的软件系统:MicroArray Suite, MicroDB以及Data Mining Tool 进行数据分析处理。根据客户的分析要求,我们将提供以下方面的数据及分析结果:

1. jpg格式芯片扫描原始图像。

    

2. 芯片的原始数据,包括原始的.DAT、.EXP和.CEL文件。

3.Excel文件形式提供每张芯片的分析结果。包含样品中所有基因的Signal、Detection和Detection p-value等信息。

4.每张芯片的Report文件。包含样品的制备质量和芯片杂交的总体信息。

5.对不同的样本进行基因差异表达的比较分析,比较分析的次数不多于客户要求服务的芯片数。并以Excel格式提供所有基因在不同芯片中表达差异分析。得到Change p-value, Increase 或 Decrease等信息。

6.提供不同样本比较分析散点图(Scatter Graph)。可以直观地反映两者信号值强度的整体差异及分布。(分析次数不超过客户要求服务的芯片数目。如客户杂交3张芯片,我们将提供3张散点图)。

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